生物碱: 尼古丁是最著名的烟草生物碱之一，它具有较强的亲水性，会在水中溶解，并且尼古丁溶液呈淡黄色至黄绿色，这取决于浓度。除了尼古丁之外，烟草中还有其它种类的生物碱，它们也能溶解于水，进一步加深水色。
色素: 烟草叶片中含有叶绿素、胡萝卜素等多种天然色素，经过发酵、晾晒和烘烤处理后，叶绿素会被破坏，转化为其他有色化合物，比如烟草特有的棕色色素。这些色素在水中溶解，使水变成深黄色。
糖分及其它水溶性化合物: 烟草中含有的糖分（如葡萄糖、果糖）以及其他水溶性有机酸、氨基酸等，在水中也会发生溶解，虽然它们对颜色变化的贡献不如前述两种成分那么明显，但也参与了整体色调的形成。
添加剂残留: 商业烟草制品在加工过程中往往会添加一些化学物质，如香精、保湿剂、稳定剂等，其中一部分也是水溶性的。这些添加剂在烟丝泡水的过程中会释放出来，有时也会对水色有所影响，不过一般不是决定性因素。
氧化作用: 在长时间浸泡过程中，水中的氧气与烟丝中的一些成分发生反应，产生新的有色物质，这也可能是水色加深的一个原因。
综上所述，烟丝泡水后呈现深黄色是烟草中多种成分共同作用的结果，这一现象不仅揭示了烟草的化学特性，也在一定程度上解释了为何烟草燃烧时产生的烟雾带有特殊的色泽。
